Rabu, 14 Oktober 2009

Apa pengertiannya, bagaimana cara kerjanya, serta apakah persoalaan tersebut???

Apa pengertiannya, bagaimana cara kerjanya, serta apakah persoalaan tersebut???

Keanekaragaman hayati

Keanekaragaman hayati biasanya dianggap pada tiga tingkatan: spesies, keragaman genetik, dan ekosistem. Kategori pertama mengacu pada keragaman dan kelimpahan spesies di wilayah geografis, jumlah spesies yang paling sederhana dan paling umum digunakan keanekaragaman hayati. Meskipun kecenderungan untuk fokus pada spesies, dengan mengandalkan spesies dan jumlah mereka pada masing-masing

spesies terdiri dari subspesies, populasi, dan individu. Bahkan, banyak keputusan konservasi praktis sasaran subspesies dan populasi daripada spesies.

Kepunahan spesies adalah contoh paling konkret hilangnya keanekaragaman hayati. Oleh harena itu, suatu spesies menjadi punah bila anggota terakhir meninggal. Hanya beberapa individu dari suatu spesies yang ada, bahwa spesies bisa menjadi punah secara fungsional, yang berarti bahwa reproduksi dan panjang kelangsungan hidup spesies itu menjadi mustahil. Sebuah spesies menjadi punah di alam liar saat satu-satunya individu hidup yang mana spesies dipelihara dalam lingkungan yang tidak alami, seperti kebun binatang.

Teori ekologi menunjukkan bahwa beberapa faktor yang berkontribusi pada kerentanan spesies tertentu merupakan kepunahan. Spesies yang paling rentan terhadap kepunahan meliputi organisme besar, spesies tinggi, spesies dengan rentang populasi kecil atau populasi ukuran, spesies yang telah berevolusi dalam isolasi, spesies dengan sedikit pengalaman, spesies dengan penyebaran miskin atau penjajahan kemampuan, migrasi spesies, dan spesies bersarang atau mereproduksi dalam koloni. Banyak pulau dan spesies endemik lokal yang terbagi dalam beberapa karakteristik di atas.

Secara keseluruhan, Kepulauan Hawaii adalah sarang ambigu dari kepunahan, meskipun mereka telah tercatat di setiap negara bagian AS. Hanya terdiri dari Hawaii sebagian kecil (kurang dari 0,2 persen) dari total luasan lahan di Amerika Serikat, tetapi menyumbang sekitar 30 persen dari kepunahan dan 50 persen dari kemungkinan kepunahan.

Faktor Manusia

Penyebab utama penurunan keanekaragaman hayati kontemporer habitat perusakan dan degradasi, didorong oleh ekspansi manusia dan kegiatannya. Hilangnya habitat adalah penyebab utama yang membahayakan untuk 85 persen dari spesies terdaftar di bawah Endangered Species Act (ESA), undang-undang federal utama yang mengatur proteksi dan pengelolaan keanekaragaman hayati. Invasif spesies penyebab kepunahan kedua spesies . Pendahuluan dapat melalui impor tanaman hias, peternakan, dan permainan spesies atau tidak sengaja, diperkenalkan melalui air pemberat, pot tanah, atau pengangkutan kontainer. Tol dari berbagai kondisi lingkungan, tingginya tingkat reproduksi dan penyebaran, dan kurangnya predator alami dalam komunitas baru adalah ciri-ciri yang membantu spesies nonnative berkembang di habitat baru.

Kekuatan adaptif beberapa spesies ini kemungkinan besar disebabkan oleh tekanan-tekanan baru, terutama bila dikombinasikan dengan fragmentasi, penurunan konektivitas habitat, dan menekankan bahwa siap mengancam banyak spesies dan dapat menciptakan hambatan tambahan penyesuaian terhadap perubahan kondisi. Contoh yang paling terkenal dari spesies seperti beruang kutub, yang baru-baru ini ditambahkan ke daftar spesies, dan secara serius terancam oleh perkiraan perubahan es laut yang terkait dengan perubahan iklim.

Bagaimana Keanekaragaman (biodiversity) Bekerja

Ahli ilmu lingkungan hidup biasanya mempertimbangkan kesempurnaan jenis ke peningkatan ekosistem, produktivitas, stabilitas, dan daya kenyal. Diakibatkan oleh eksperimen bidang jangka panjang menunjukkan bahwa walaupun kesempurnaan jenis dan menghasilkan kompetisi yang terjadi diantara spesies menyebabkan fluktuasi di dalam populasi jenisnya. Keanekaragaman cenderung meningkatkan stabilitas produksi dalam suatu ekosistem secara keseluruhan. Konsep ini serupa dengan teori fortofolio dalam bidang ekonomi, yang menggambarkan bagaimana penganekaragaman bursa fortofolio/ stok dapat secara efektif memindahkan resiko stok-spesifik kembali (itu adalah, biomassa didalam prroduksi utama) yang dihasilkan dengan jenis berbeda tidaklah sempurna dihubungkan melainkan berubah biomassa produksi oleh beberapa jenis yang dihubungkan.

Dengan kata lain, suatu jumlah tinggi jenis bertindak sebagai suatu penyangga/bantalan melawan terhadap produktivitas pengurangan di dalam jenis tunggal manapun, dan ekosistem dengan angka-angka jenis yang lebih besar mengalami lebih sedikit fluktuasi di dalam kumpulan biomass produksi.

Mengintegrasikan Ekonomi dan Ekologi untuk Bantuan Pertahankan Keanekaragaman Hayati

Satu kepastian dalam menentukan jangka panjang sesuai keanekaragaman hayati

kebijakannya adalah bahwa ekonomi dan ekologi yang tidak dapat dihindari. Berhasil mengidentifikasi strategi untuk melestarikan keanekaragaman hayati memerlukan tegrating ekonomi dan ekologi. Karena sebagian besar keanekaragaman hayati menempati cadangan, memeriksa alternatif strategi manajemen untuk daerah yang menggunakan secara terpusat penting. Memahami perubahan pemanfaatan lahan, serta sebagai pemilik tanah referensi dan perilaku relatif terhadap alternatif kebijakan konservasi keanekaragaman hayati, adalah membantu dalam menemukan pendekatan praktis untuk melindungi keanekaragaman hayati.

Glycine N-methyltransferase Adalah Sebuah Contoh Keanekaragaman Fungsional Berperan Sebagai suatu polycyclic hidrokarbon aromatic-Reseptor pengikat

Sitokrom P-4501A1 (CYP1A1) gen diatur oleh beberapa faktor trans-acting termasuk 4 S polycyclic aromatik hidrokarbon (PAH)-binding protein, yang baru-baru ini diidentifikasi sebagai N-methyltransferase glisin (GNMT) (Raha, A., Wagner, C., Macdonald, R. G., dan Bresnick, E. (1994) J. Biol. Chem. 269, 5750 -- 5756). Peran GNMT sebagai 4 S PAH-mengikat protein menengahi induksi sitokrom P-4501A1. Beberapa klon positif dipilih oleh transcription-polymerase reaksi berantai dan diuji untuk ekspresi protein rekombinan.
Hidrokarbon Polisiklik Aromatik seperti B [a] P1, 3 methylcholanthrene, dan TCDD adalah polusi lingkungan yang mendatangkan berbagai beracun, teratogenic, dan karsinogenik tanggapan di terekspos hewan (1-7). Induksi diperantarai oleh reseptor seperti reseptor Ah (atau dioxin reseptor, 8 S protein). Mekanisme Ah yang diperantarai reseptor dicirikan dari yang terbaik dan paling luas diterima PAH-model untuk ekspresi induksi CYP1A1 (9, 10). Ligan mengikat Ah reseptor yang bergantung pada suhu transformasi didampingi oleh translokasi ke inti di mana kompleks ligan mengikat reseptor spesifik cis-elemen (juga dikenal sebagai XREs dan Dres) hadir di 59-peraturan daerah CYP1A1 dan dari beberapa gen lain Ah. Hasil dari interaksi tersebut adalah Ah transkripsional responsif aktivasi gen (3, 5, 6, 11). Ah reseptor yang berisi 95-kDa loop helix-heliks motif, karakteristik beberapa transkripsional aktivator (12, 13).
Peruntunan parsial dari 33-kDa protein 4 S menunjukkan identitasnya sebagai GNMT (S-adenosylmethionine: glisin N-methyltransferase, EC 2.1.1.20). Berdasarkan sejumlah kriteria, GNMT dan 4 S PAH-mengikat protein yang ditampilkan untuk menjadi satu dan menjadi protein yang sama (34).
Kami menyimpulkan GNMT terlibat dalam aktivasi transkripsional dari CYP1A1, sehingga memberikan alternatif, Ah reseptor-mempunayi jalur tersendiri untuk modulasi ekspresi CYP1A1 oleh tertentu PAHs, seperti B [a] P, B [e] P, dan 3-methylcholanthrene.


Bahan Dan Metode

Kimia-medium kultur jaringan, yang-lumayan penting, serum janin sapi, gentamycin, geneticin (G418), dan Lipofectin itu dibeli dari Life Technologies, Inc sumber bahan lain adalah: [a-32P] dATP dari ICN biokimia (Irvine, CA); [3H] B [a] P
(60 Ci / mmol) dari Amersham Corp; [3H] TCDD (41 Ci / mmol) dari Chem-Syn Science Labs (Lenexa, KS); Immobilon P dari Millipore (Bedford, MA); S & S mentransfer membran dari Schleicher & Schuell (Keene, NH); BM Chemiluminescence blotting Barat kit dari Biochemica Boehringer Mannheim Corp (Indianapolis, IN); Tris, TEMED,Tween 20, B [a] P, B [e] P, 3-methylcholanthrene, TCDD, Isositrat dehidrogenase, nikotinamida, ethoxyresorufin, dan resorufin dari Sigma. Ah reseptor yang mengandung plasmid cDNA itu baik disediakan oleh Dr Chris Bradfield (University of Wisconsin).
Plasmid konstruksi dan transfection-The GNMT cDNA ini disintesis dengan RT-PCR metodologi dari hati tikus poli (A) 1 RNA persiapan.GNMT spesifik yang maju dan reverse primer adalah 59-GAGCCAGCTAGCGTCAGGATGGTGGAC dan 59-TGGGAGCTCGAGCCAGGCTCAGCCTGT, masing-masing. Produk berikutnya dimurnikan dengan gel agarosa electophoresis, dan urutan ini ditunjukkan identik dengan diterbitkan GNMT cDNA (43). Dua situs kloning untuk NheI dan XhoI dimasukkan ke dalam daerah noncoding dari GNMT cDNA oleh metodologi PCR. Yang disucikan DNA beruntai ganda Produk ini diligasi ke NheI / XhoI-dicerna pMAMneo (CLONTECH, Palo Alto, CA). Plasmid membangun, pMAMneo / GNMT, berisi yang GNMT masukkan dari ukuran yang sesuai dalam arti orientasi sebagai ditentukan oleh urutan pembatasan pencernaan dan tekad. pMAMneo / GNMT adalah transfected ke sel CHO oleh Lipofectin metode. Singkat, pada hari 0, 10 mg DNA dalam 100 ml Opti-MEM aku dicampur dengan 15 ml Lipofectin reagen, dilapisi ke sekitar 2 3 105 sel dalam 2 ml serum pertumbuhan bebas menengah, dan diinkubasi selama 24 jam pada 37 ° C dalam inkubator CO2. DNS transfectants didirikan menggunakan DNA dari plasmid pMAMneo orangtua. Pada hari 1, DNA menengah digantikan oleh standar serum-termasuk pertumbuhan menengah, dan inkubasi dilanjutkan untuk tambahan 48 h. Pada hari 4, sel-sel ditempatkan dalam medium yang mengandung pilihan geneticin (0,4 mg / ml). Klon sel tunggal yang dipetik, ditanam di medium seleksi, dan diuji untuk GNMT ekspresi melalui Western blotting dan B [a] P Aktivitas mengikat. SDS-Polyacrylamide Gel Elektroforesis dan Western blotting-The transfected secara stabil klon sudah dewasa dalam medium minimal esensial mengandung 0,4 mg / ml G418, 10% dialyzed serum janin sapi, dan 1 mM deksametason.

Hasil

Kurangnya aktivitas reseptor Ah dikonfirmasi oleh fungsional assay nuklir melibatkan XRE translokasi dan mengikat eksperimen dengan GNMT CHO-sel; HEPA-1 tikus hepatoma sel digunakan sebagai kontrol positif . Pembentukan dari XRE-Ah reseptor kompleks ditunjukkan dengan ekstrak dari cytosolic HEPA-1 sel yang telah diperlakukan in vitro dengan TCDD (jalur 2). Tidak kompleks seperti demonstrasi -
FIG. 3. Analisis gradien densitas sukrosa B [a] p (A) dan TCDD (B) cytosolic CHO mengikat dengan protein. The cytosolic protein (0,5-1 mg) telah diinkubasi dengan [3H] B [a] P (A) atau [3H] TCDD (B) untuk 60 menit pada 4 ° C dan selama 2 jam pada suhu kamar, masing-masing
Pembentukan reseptor XRE-Ah rumit juga dibuktikan dengan ekstrak nuklir dibuat dari HEPA-1 sel yang telah diperlakukan in vivo dengan TCDD (jalur 4). Sekali lagi, tidak kompleks seperti diamati dengan diobati TCDD-CHO-GNMT ekstrak nuklir (jalur 8).

Diskusi

Sebagai kesimpulan kami telah menunjukkan bahwa GNMT adalah PAH-binding protein yang menjadi perantara induksi CYP1A1 oleh Ah reseptor-jalur independen. Penyelidikan tambahan diperlukan untuk lebih memahami faktor-faktor yang mengatur
GNMT jumlah dan karena itu dimerik mengendalikan ekspresi dari CYP1A1.